蛋白质设计研究组

  蛋白质设计研究组

  一、研究组介绍

  研究组成立于2010年,现有成员共16人,其中工作人员8人,来自国内外8所大学和科研机构,具有博士学位的5人,研究背景涵盖化学、物理化学、生物化学与分子生物学和微生物学等学科;研究组在读博士生6名,硕士生2名,已培养博士生6名,硕士生5名。

  二、研究组负责人简介

  姚礼山

  电子邮箱: yaols@qibebt.ac.cn 

  电话:0532-80662792  手机15966846206

  研究方向:

  发展生物核磁共振方法研究蛋白质与配体分子间、蛋白质分子内作用机制以及蛋白质多尺度动力学性质;结合计算模拟和分子生物学实验设计新型功能蛋白质和酶,提高蛋白质的稳定性和耐受性、酶催化选择性和活性;结合量子力学计算和分子动力学模拟研究酶催化反应机理。

  个人经历:

  2010-06至今, 中科院青岛生物能源与过程研究所,研究员;2006-06至2010-05,美国国立健康中心, 博士后;2001-07至2006-05 密西根州立大学,物理化学博士。

  承担项目:

  主持中组部“WR计划青年拔尖人才”项目、山东省“泰山学者特聘专家”项目、国家自然科学基金面上项目3项、国家自然科学基金国际合作项目1项、中科院“BR计划”项目及山东省“杰出青年”基金等项目。

  三、 研究进展

  1.科研成果

  (1)研究组事迹

  1) 2021.06.25恭喜我组硕士研究生袁晓翔,周栩晨顺利毕业;

  2)2020.12.01恭喜我组博士研究生王梦婷获得“唐立新”奖学金。

  3) https://www.sohu.com/a/229225346_343161 

  4) http://www.cas.cn/syky/201612/t20161229_4586453.shtml 

  (2)科研成果

  在领域发表SCI论文60余篇,其中在研究所期间以唯一通讯作者和第一作者在JACS期刊发表文章6篇,ACIE 1篇。发表累计他引300余次。授权国内发明专利2项。

  2.代表性论文

  (1) Song Xiangfei; LvTianhang; Chen Jingfei; Wang Jia; Yao Lishan. Characterization of Residue Specific Protein Folding and Unfolding Dynamics in Cells. Journal of the American Chemical Society, 2019, 141 (29), 11363-11366.

  (2) Li Jingwen; Wang Yefei; An Liaoyuan; Chen Jingfei;Yao Lishan. Direct Observation of CH/CH van der Waals Interactions in Proteins by NMR. Journal of the American Chemical Society, 2018, 140, 3194-3197.

  (3) Zhang Ning; An Liaoyuan; Li Jingwen; Liu Zhijun; Yao Lishan. Quinary Interactions Weaken the Electric Field Generated by Protein Side-Chain Charges in the Cell-like Environment. Journal of the American Chemical Society, 2017, 139, 647-654.

  (4) Li Jingwen; Wang Yefei; Chen Jingfei; Liu Zhijun; Bax Ad; Yao Lishan. Observation of alpha-Helical Hydrogen-Bond Cooperativity in an Intact Protein. Journal of the American Chemical Society, 2016, 138, 1824-1827.  

  (5)An Liaoyuan; Wang Yefei; Zhang Ning; Yan Shihai; Bax Ad; Yao Lishan. Protein Apparent Dielectric Constant and Its Temperature Dependence from Remote Chemical Shift Effects.Journal of the American Chemical Society, 2014, 136, 12816?12819.

  (6) Song Xiangfei;An Liaoyuan; Wang Mengting; Yao Lishan. Osmolytes Can Destabilize Proteins in Cells by Modulating Electrostatics and Quinary Interactions. ACS Chemical Biology, 2021, 16(5)864–871.

  (7)WangYefei; An Liaoyuan; Yang Ying; Yao Lishan.Generating FiveIndependent Molecular Alignments for Simultaneous Protein Structure andDynamics Determination Using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy. Analytical Chemistry, 2020,92(23):15263-15269.

  (8) Li Jingwen; Chen Jingfei;An Liaoyuan; Yao Lishan. Polyol and sugar osmolytes can shorten protein hydrogen bonds to modulate function. Communications Biology, 2020, 3(1): 528.

  (9) WangJia; Chen Jingfei; Li Jingwen;An Liaoyuan;Wang Yefei; HuangQingshan; YaoLishan. Arginine side chain stacking with peptide plane stabilizes the protein helix conformation in a cooperative way, Proteins, 2018; 1~9.

  (10) Zhang Ning; Wang Yefei; An Liaoyuan; Song Xiangfei; HuangQingshan; Liu Zhijun; Yao Lishan. Entropy Drives the Formation of Salt Bridges in the Protein GB3.AngewandteChemie International Edition, 2017, 56, 7601-7604.

  3.专利

  1. 姚礼山,宋乡飞,王业飞,一种改良性能的黄素单核苷酸结合荧光蛋白质,2012年,中国, ZL 201210160241.3.

  2. 姚礼山,宋乡飞,王业飞,张树军,张雨,洪景波. 一种改良性能的纤维素内切酶Cel7B突变体. 2015年,中国, ZL 201510049724.X


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